Tanoto Foundation bermitra dengan berbagai perguruan tinggi di Indonesia maupun internasional untuk mendukung perbaikan mutu pendidikan di jenjang pendidikan tinggi secara holistik. Hal ini dilakukan melalui dukungan perbaikan “hardware” seperti sarana dan prasarana pendidikan maupun peningkatan “software” yang mencakup kemampuan dosen dalam melaksanakan tugasnya.